Las Comisiones Técnicas están formadas por todos los técnicos de cada una de las empresas asociadas. Las Comisiones Técnicas se reúnen de forma presencial dos veces al año y están asistidas por el personal del Área de Asuntos Reglamentarios de Afepadi. En estas reuniones se hace un repaso general de todos los asuntos técnicos, legislativos y regulatorios, en proceso, vigentes y de actualidad, que son de interés para las empresas del sector de los complementos alimenticios, alimentos destinados al control de peso y alimentos destinados a deportistas.

Los Grupos de Trabajo están formados por unos pocos técnicos de las empresas asociadas como expertos en una materia determinada. Existen tantos Grupos de Trabajo como temas de interés. Las reuniones se llevan a cabo de forma telemática con la frecuencia necesaria en cada caso y están asistidas por el personal del Área de Asuntos Reglamentarios de Afepadi. Esta metodología permite mantener un contacto fluido entre los miembros de cada Grupo y la Secretaria para abordar las tareas a desarrollar minimizando el tiempo dedicado a ello, con un considerable ahorro de tiempo de desplazamiento. En los diferentes Grupos de Trabajo se obtiene una posición consensuada del sector que, tras la aprobación de la Junta Directiva y Asamblea, se presentaría y defendería ante los foros oportunos, tanto nacionales como europeos.